陈阿信看着主公在安不纳群岛上标注万生县，提议道：“启禀主公，标下以为万生县当划归海市府，便于管理，另外可在汶岛（邦加岛）一带设置直隶州汶州。”
赵明朗非常赞同道：“陈院使言之有理，海市府有南洋水师第一编队驻守，便于管理万生县，在汶岛设置直隶州可应对旧港飞龙国进犯。”
“甚好”陈瀚当即拍板道：“万生县就划归海市府管辖，海市府下辖海市、狮城、巴淡、宾坦、万生、龙牙（林加群岛）六县，于汶岛设直隶州汶州，暂归海市府代管。”
陈瀚接着指向马来半岛道：“我们决定将柔佛、朋丰、吉兰丹三国设府县管理，同时保留柔佛国，在柔佛国蝙蝠城设柔佛府，于彭城设彭城府，在大汉城设汉山府，于哥打巴鲁城设吉海府。”
刘阿杰提议道：“主公，婆罗洲为南洋诸岛之最，岛上森林密布，人烟稀少，北方人口较多，标下以为可在北方设古晋、南海、文莱三府，于南方设婆罗、渤泥两府。”
李阿岚附和道：“刘队长言之有理”
“好，就在婆罗洲设五府统管。”陈瀚指向西爪哇岛道：“现已迁徙六万北方移民移居西爪哇，加上西爪哇有不少我华夏遗民，便于统治管理，我决定在西爪哇分设椰城、仙城、雷都、爪哇、汶海五府。”
徐渭问道：“主公，爪哇经略陈阿靖可是统管军政？”
陈瀚转身看向一众文武道：“陈阿靖暂时统管爪哇军政，陈阿靖毕竟是武将，还兼任西洋商行武装船队队长一职，军政法三院准备推举南洋各府县文武名单上报给我。
我会从南洋华人华侨以及归顺的当地文武中选拔人才委以府县之职，华人张那督已归顺，正领兵出征南婆罗洲，张那督在渤泥国内素有威望，就命其为渤泥知府，暂领渤泥府军政。命童龙为婆罗府知府，暂领婆罗府军政。”
“标下（下官）遵命”一众文武纷纷领命
陈瀚接着下令道：“免去陈阿靖西洋商行武装船队队长一职，由袁八接任。袁八正率西洋商行武装船队向东探索建立商路，暂由李新统领西洋商行南洋一切事务。”
负责记录起草文书的徐光启忙着起草公文
一众三院院使纷纷各抒己见，推荐府县官员人选名单，陈瀚在舆图上勾画一番道：“在金兰湾设金兰县，由游击将军府直接统管。
在台海十二县增设台海、台中、台东三县，改淡水城为台海城，设台海县，迁淡水县于淡水港。改大肚县为台中县，迁大肚县于大肚溪以南。于台湾县小淡水河以东设台东县，台海游击将军府直接统管十六县。”
“标下（下官）遵命”一众文武忙领命
徐渭禀道：“启禀主公，渭以为我台海游击将军府大军在南洋诸岛开拓海外疆土不少，正所谓欲速则不达，需得暂停开疆拓土，巩固加强对海外疆土统治。”
“军师言之有理”赵明朗非常赞同道：“主公，我们需得加强对南洋疆土巩固统治。”
“不错”陈瀚深感赞同，派往南洋的将士在南洋所向披靡，扩张迅猛，是该暂停扩张，消化巩固开拓的南洋疆土，处理好内部矛盾。
陈瀚随即下令道：“传令，暂停在南洋扩张，加强巩固南洋疆土统治，命王安海与李新尽快立柔佛王女为柔佛女王，命西洋商行避免与西洋诸国武装冲突。”
“是”徐光启起身领命称赞道：“主公英明决策”随即开始起草公文
陈瀚看向赵明朗问道：“粮草辎重准备如何？”
赵明朗忙回道：“回主公，标下已调集十万石粮食至那霸港、今归仁城，尚有十万石囤积于淡水港、基隆港，可供六万大军四月所需。”
陈瀚吩咐道：“多调集粮草辎重尽快运往琉球国存放。”
“是”赵明朗最近一直很忙，主公秋后出兵征伐日本将近，粮草辎重先期运送就够头疼，尤其是粮食征集很困难，整个台海十二县只征收到十万石夏粮，西洋商行从南洋贩运来的粮食也尽数征调运到琉球国那霸港、今归仁城。
陈瀚随即吩咐道：“速召见安南国莫朝使臣莫玉辇”
“是”王旭领命前去引领安南国使臣前来
没多久，王旭带着身穿安南国莫朝朝服身形瘦矮的安南国莫朝使臣莫玉辇进大堂来，约莫三十来岁的莫玉辇一张瘦猴脸，目光不时斜视着左右的一众台海游击将军府文武。
莫玉辇上前朝着陈瀚躬身见礼道：“安南国使臣莫玉辇参见游击将军”
“还敢自称安南国”陈瀚看向莫玉辇玩味地问道：“我若没记错，朝廷早已下诏降安南国为安南都统使司，何来安南国。”
莫登庸篡权夺位建立莫朝后，嘉靖皇帝决定趁机出兵安南，嘉靖帝准备派大军征讨莫登庸。莫登庸担心重蹈胡朝覆辙，亲率侄子众臣自缚前往广西镇南关谢罪。
莫登庸自缚前往汪文盛军中投降，顿首认罪。献上地图和金银珠宝等物，请求内属明朝。并割让高平一带的安广、永安州、澌浮、金勒、古森、了葛、安良、罗浮诸洞土地给明朝。
莫登庸随即派遣阮文泰、许三省等人赴北京献表投降，明将毛伯等人也来到北京，奏称莫登庸投降之事。嘉靖帝准其投降，令广西布政司颁赐《大统历》。
下诏降安南国为安南都统使司，封莫登庸为安南都统使，轶从二品，世袭，银印。子孙世袭此职，安南内政悉听其管理。安南法理上成了内属明朝的自治单位。
莫玉辇被问得哑口无言，莫朝自太祖莫登庸开始一直心安里得对明自称都统使，对内继续称帝建元。莫朝内斗严重，急剧衰落，眼看就要被南方的后黎朝攻到升龙城下，莫玉辇忙解释道：“游击大人谅解，一时情急之下说错。”
“无妨”陈瀚自是不会与莫玉辇计较，当即问道：“听闻安南都统使欲向我台海游击将军府购买军火？”
“正是”莫玉辇见陈瀚主动提起此事，看来是决定卖军火给自己了，当下请求道：“我安南都统使司南方乱贼郑松正出兵大举进攻升龙城，还请游击大人准许我安南都统使司购买佛朗机炮五十门以及鸟铳五千支，抵御南方反贼。”
对于安南国后黎朝来说莫朝君臣才是篡权夺位的乱臣贼子，莫朝自莫登庸开国卖国割地求生，更是安南国之耻。
陈瀚看向莫玉辇道：“安南都统使司与我台海游击将军府同属国朝，我自是不会坐视安南都统使司南方乱贼攻破升龙城，准许安南都统使司购买军火。”
“谢游击大人”莫玉辇闻言喜不自胜暗道：“太祖高瞻远瞩，安南名义上为大明安南都统使司，在危难之时，大明必然会出手相助，想不到台海游击将军陈瀚更是对安南都统使司如此看重，欣然答应出手军火相助。”
陈瀚看向王平安吩咐道：“就由王院使负责与安南都统使司使者商谈购买军火一事”
“标下遵命”王平安当即领命
莫玉辇前脚刚出大堂，真腊国使臣森海随后闻风赶来，正好与莫玉辇擦肩而过，两人互相看了对方一眼，森海忙带着几名随从进大堂来躬身见礼道：“真腊使臣森海见过游击大人”
“免礼”陈瀚看向森海问道：“真腊使臣有何要事？”
森海忙道：“我真腊国想再购买一批军火，还请游击大人准许。”
徐渭上前问道：“真腊国已击退暹罗大军，使臣为何再次提出购买军火，需得说明缘由？”
森海沉思片刻道：“暹罗大军侵入我真腊国内，虽购得游击大人火器相助击退暹罗大军，但暹罗国王纳黎宣已击败缅甸大军，必会再派大军进攻我真腊国，我王因此派我前来向游击大人再购买一批火器抵御暹罗国大军进攻，还请游击大人准许。”
陈瀚问道：“听闻贵国与缅甸莽应里结盟，果真如此吗？”
森海为之一惊，忙解释道：“我真腊国并未与缅甸国结盟，我们之间用中原话讲叫唇亡齿寒。暹罗王纳黎宣大军入侵我真腊国，我真腊国只是趁缅甸国王出兵进攻暹罗之时发兵进攻暹罗。”
林江禀道：“启禀主公，真腊国国力较弱，遭受暹罗国王纳黎宣大军进攻，不得不引外援相助，实为明智之举。”
“缅甸莽应里父子进攻国朝数十载，真腊国岂能与缅甸不约而同进攻暹罗。”徐渭当即喝止道：“何况缅甸莽应里接连战败，已是秋后蚂蚱，蹦跶不了几下。南洋大势在我大明，不在莽应里、纳黎宣二人。”
陈瀚虎视森海道：“真腊国需得尽早做出抉择，缅甸与我大明只能选其一。”
森海沉思片刻后问道：“若暹罗国再入侵我真腊国，上国可愿出兵救我真腊国。”
陈瀚道：“我会派使者为暹罗真腊两国调停战争，不知贵国可愿否？”
“若暹罗大军退出我真腊，我真腊自是愿接受调停。”森海提醒道：“暹罗国王纳黎宣野心勃勃，一心想攻灭我真腊国，只怕不愿接受调停，若是纳黎宣不接受调停，游击大人当如何处置。”
徐渭道：“我台海游击将军府会出兵迫使暹罗接受调停”
森海喜出望外道：“太好了”
王平安随即禀道：“启禀主公，军器库中库存佛朗机炮、鸟铳已卖给安南都统使司，真腊国求购火器一事需得等军器厂生产出来再出售。”
“也只能如此了”陈瀚看向森海爱莫能助道：“真腊使臣可愿留下等候？”
“多谢游击大人，我们就此告辞回国。”森海一听陈瀚将军火卖给了安南人，自己来晚了一步，却是大有收获，获得台海游击将军府承若调停，有台海游击将军府支持，纳黎宣也不得不掂量掂量。
台海游击将军府在南洋扩张势头开始逐步暂停下来，转为巩固加强对南洋疆土统治，加大移民前往南洋开垦田地生息。准备出兵进攻马打蓝王国的爪哇经略陈阿靖也被迫暂停进攻计划，改为屯垦备战。
莽瑞体建立东吁王朝后，开始大举进攻统治缅甸却不作为的明朝云南，继任的莽应龙于1552年灭勃固王朝，孟人遭到东吁王朝残酷统治，东吁王莽应里为加强对孟人统治更是迁都勃固城。
陈阿仲率西洋商行武装船队前往缅甸南部的孟人聚居的毛淡棉、马都八港口与各国海商通商往来。陈阿仲与孟人首领基特、猛撞建立起盟友关系，并承若帮助孟人起兵复国。
陈瀚下达在南洋暂停扩张令，下令西洋商行避免与西洋诸国武装冲突，迅速从海市城传到桉笃蛮港，陈阿仲接到命令后，要求孟人首领基特、猛撞暗中积蓄兵力，等待时机。孟人数次反抗都被东吁王朝镇压下来，也不敢轻易起兵。