紧接着，这个资料又对人类建造加速器的方式进行了批评：“……因此，人们总想搞清楚物质的奥秘，最初，人们建造了静电加速器，试图‘打破’原子，看看里面到底是什么。后来，人们通过加速器和自然界存在的放射性元素发现了原子里面有电子和原子核，再后来发现了质子和中子。人们还想知道原子核之中的奥秘，于是建造了更大、能量更高的加速器。原子核内的作用能量大概是ev兆电子伏特的量级，而人们建造的加速器能量高到gev十亿电子伏、tev万亿电子伏甚至更高，但研究方式只有一种----碰撞，野蛮的碰撞！人们试图用野蛮的粒子碰撞来发现原子核之中的奥秘，却不知道，他们可以用更灵巧、更精确的方式来改变原子核，做成他们想要的东西。诚然，强烈的碰撞可以把核内部深藏的东西‘打’出来，但仅仅是发现其内部结构是没有用的，自然界的粒子只会散漫地堆叠在一起，按照能量最低原理形成各种结构，质子、中子、原子核。人们孜孜不倦地追求新的高能粒子的发现，却没想过即使发现了这些高能粒子，它们却对现阶段的人类没有任何作用！
人类利用物质的能力，向来是循序渐进的。例如，能够自由建设宏观的机器设备，于是人们就可以建造加速器，研究物质的微观结构，然后发现并能够利用核能，这是对人类有用的。后来，人类能够操纵微观的分子和原子，形成各种各样特殊性质的东西，然而，他们还没掌握原子层级的操控技术的时候，就好高骛远地向物质的更深层次发起冲击，寻找夸克、‘消失的粒子这里指希格斯粒子’，甚至试图寻找夸克层级以下的东西，实际，这些步伐迈得过早了！有这个时间、精力和金钱，还不如去研究如何熟练操控分子和原子，站稳这一步之后就研究如何操控重子，当人类研究透重子之后，这时才是向夸克以下层级进军的时候。”
“……许多年后，人们发现建造更高能量的加速器越来越困难，想要追求物质的本源、宇宙的初始，所需要粒子的能量越来越高，人们却没有足够厉害的材料可供使用，那么获得这种粒子的困难度简直比天文数字还可怕！此时，人们遭到了挫败，这才回过头来研究如何才能自由地操控粒子，然后一步步稳扎稳打地向更深层次迈进……”
“……这，是我们文明在探索物质本质的过程中走过的弯路，现在我们记录下来，希望别的尚未发展起来的文明能够获得这份资料，不要再走我们走过的弯路。”
看到这里，刘云才明白，原来系统是在搜刮别的文明的技术资料，然后丢给玩家去研究，而玩家基本是地球人“主神”们的敌人是仙人，仙人的后裔是华人，不是外星人，至于玩家能不能看懂就不知道了。
这份资料说了一大堆他们的“科学史”之后，才说到真正的技术内容，要操控重子，首先就要建造许多个结构精巧的加速器，能量不用太高，但结构很特殊，很精巧。要知道，原子核的直径只有飞米10e－15米的量级，是纳米的一百万分之一，操纵原子就是一项精细的工作，何况操纵重子了。所以，这些加速器的核心部件有时候要精确到每一个原子，在关键部位若是多了一个原子，可能就要坏事，所以，难度非常高。而且，就如资料里所说的，操控重子之前，先要掌握如何自由操控分子和原子，所以这里又附加了一大堆纳米技术的资料。
“靠！说了半天，正课还没开始，还得补习班！”刘云相当气愤，本来他以为能学到什么高深的技术，没想到技术太高深了，需要先补习班，先打好基础才行！
“噗哧！”梅青看到刘云那个样子，忍不住笑了。刘云瞪了她一眼，“笑什么笑！我不是在着急嘛，真是的，这系统，搞这么高深的东西给我，到头来看得见吃不着。”刘云一脸愤愤的样子，似乎系统卖假药给他似的。
“我没笑……嘻嘻……”梅青掩着小嘴，努力忍住笑意，半天才平静下来，劝道，“其实，这里说得没错，路要一步一步走，饭要一口一口吃，循序渐进总是最好的办法。我知道你的心神能够操控原子，但这只是你功法的作用，并不表示你已经掌握了这种技术，即使你成功建成那种加速器，也只是空中楼阁而已。何况，这里还提供了许多纳米技术，我们为何不趁机吸收利用呢？利用好了，我们的技术也能迈一个台阶！”
“嗯，也是。”刘云只是小发点脾气，过后就好了，然后就开始钻研起纳米技术来。不得不说，比起操控重子的技术，纳米技术实在是简单多了，现在刘云的强悍心神可以直接操控原子，所以研究起纳米技术来实在是得心应手，他们以前也有纳米技术，但那只是很初级的那种，就像二十一世纪初人类的纳米技术一样。那种纳米技术，只能搞搞“防水布”，“不用洗的衣服”，“优良的电池”等等，科研方面也只是整天玩一点“碳纳米管”，或者纳米管里装些乱七八糟的东西，然后就可以写论文，发表……咳，扯远了，这是在地球时的工作。
这种纳米技术，首先就是制造纳米机器人。制造纳米机器人可不能像制造碳纳米管那样，用化学物理手段生成一大堆纳米管，然后从中挑选比较好的那部分。制造纳米机器人需要一个一个地移动原子，用原子搭建出一个纳米机器人。所以，制造纳米机器人的基本设备是一些超精密原子显微镜，就是能用针尖“看到”原子，并且移动原子的显微镜，不过这种显微镜拥有多个针尖，可以用原子搭建立体的结构，而不是ib那种只能在平面移动原子的层次。是的，这是一项很精细的工作，而且只能造出一个，只有一个纳米器件，太少了，不是吗？当然，一个纳米机器人显然无法派用场，而日后批量的纳米机器人也不能通过移动原子的方式来制造，必须让纳米机器人可以自我复制。
要让纳米机器人能够自我复制，这可不是一项简单的工作，这是一项复杂的系统工程。资料说：“要让一个东西自我复制，那么你最好的老师不是别人，正是生物本身。生命是自然界最神奇的创造物，人们可以从中学到许多东西。我们知道，细胞中有dn、rn、核糖体、t和其他细胞器，其中dn用来储存信息，一部分rn用来转录信息，dn可以自我复制，而rn可以通过dn制造出来，核糖体是蛋白质的‘制造工厂’，t是细胞的能源。那么我们可以模仿生物，制造出拥有这样功能的纳米机器人。
首先，是类似dn的纳米机器人，我们叫它‘记忆体’，其结构我们也可以模仿生物，做成双链型，而双链的每一对单元都必须互相配对，那么我们可以设计一些互相吻合的结构。不过，单单dn无法自我复制，生物里面dn的复制还需要一些酶，那么我们也可以制造类似功能的纳米机器人，我们叫它‘催化体’，然后记忆体的自我复制需要能量，我们也可以制造一些拥有较高化学能，可以重复‘充电’使用的‘能量体’，这种能量体的结构必须和催化体，以及后面用来组装的纳米机器人吻合，其化学能可以方便地使用……”
具体的纳米技术还是很复杂，不过，总体原理是模仿生物，dn对应记忆体，rn对应转录体，酶对应催化体，t对应能量体，核糖体对应装配体。其中，装配体这种纳米机器人可以由能量体提供能量，然后可以移动原子，组装成复杂的结构，同时，记忆体面的信息对应一套“装配密码”，可以指挥装配体移动不同的原子，组装成不同的结构，这个装配密码可以由研究者自行设定，只要能让装配体成功实现装配步骤就行，不能出现任何差错！最后，这种装配体必须能制造其本身，并能制造除记忆体和转录体之外的任何纳米机器人。当然，如果组装能量体的话，是无法组装出高能态的能量体的，只能组装出低能态的能量体，然后通过一个“充电”过程，给能量体补充能量。
这里要提一下这个“能量体”，它不是像生物那样，通过吃掉有机物，然后氧化，有机物能量被d吸收，形成t，这种叫做能量体的纳米机器人，可以通过电能来达到高能态，不需要什么有机物，这就是纳米机器人的多样性，竟然能实现这种功能。实际，能量体分两部分，低能态时是电离的，电离后带了大量的电荷纳米机器人也算是大分子，只需在能量子溶液里通电，那么能量体的两部分就会在阴极处结合，电能转化为化学能储存起来。这样是为了方便大量生产纳米机器人，只需大量的电能就可以批量生产，不像生物那样需要喂食，然后等它养大最后生崽。
有了这些纳米机器人，那么就可以大量复制了。事实，要得到这些纳米机器人的合理结构，需要无数次试验，而今刘云直接得到这些资料，就可以自行制造了。另外，刘云不需要制造什么超精密原子显微镜，不需要仪器，只需心神程序就能移动原子，并且自由组合，这真是逆天的技能，所以得知那些纳米机器人的结构后，立刻就可以制造了。
除了可以用记忆体面的信息来控制纳米机器人的行为，还可以在纳米机器人的某部位安装磁性端，这样就可以用精细磁场来辅助控制纳米机器人。另外，纳米机器人的自我复制必须受到控制，不能像病毒一样肆无忌惮地复制，所以，必须加入“总开关”，可以通过特殊的催化体来实现总开关的功能，另外也可以模仿自然界生物dn的端粒，给记忆体安装一段复制一次就缩短一次的端粒，用来控制其寿命，生物细胞的寿命就是由dn的端粒来控制的还有端粒酶可以加长和修补端粒，这种端粒酶一般出现在生殖细胞等无限复制的细胞之中。
数日后，刘云手中拿着一个培养皿，啧啧叹道：“这些纳米机器人，这些个小玩意儿，竟然也能制造大型机械？真是太不可思议了。”
梅青嗔怪地瞪了他一眼，道：“得了，瞧你那口气，看似自谦，实际是在炫耀，天下间也就只有你才能在短短数天内做出这么成功的纳米机器人了。”
刘云得意地捏了一把梅青娇嫩的脸蛋，倒是闹了她一个大红脸。刘云嘿嘿笑道：“怕羞什么，天经地义的事情……咳咳！”刘云在梅青红着脸把手指伸到他腰间之前，立即摆出一副“正人君子”的嘴脸，道，“其实，这些纳米机器人的最成功之处，还在于可以用电磁信号控制它们的建造，否则光靠记忆体，也就是类似dn的东西来控制，那速度可是慢得紧，那么我们只需配好蕴含各种原材料的‘营养液’，补充足够的能量体溶液，就可以让这些纳米机器人来建造我们能造的任何东西，什么光电芯片、硬盘等电子设备，还有枪支弹药，甚至是坦克军舰这一类大型机械……不过，现在还没法建造大型机械，我们得好好研究大型机械的建造步骤才行，这个得等一段时间。”
现在，刘云的纳米机器人已经可以建造一些小东西了，例如，刘云现在将培养皿里的纳米机器人倒入一个较大的培养缸里，然后充入营养液和能量体，再在控制台运行预先编好的建造程序，然后，这些纳米机器人就开始建造了。
首先，是自我复制，纳米机器人就像微生物一样，以几何级数的速度开始自我复制，几分钟数量就翻一番，直到数量达到预定值的时候才停止。紧接着，这些纳米机器人就开始搬运原子、分子，消耗着能量体的能量，同时培养缸也在给能量体充电。就这样，数小时之后，一把0式自动步枪刘云擅自命名的自动步枪就成型了，其“生长过程”就像胚胎的发育一样，刘云可是按照模仿生物的宗旨设计的。与此同时，三十发弹药也已经“长成”，子弹里面的发射药不是湿的，因为自有纳米机器人把里面的水分子搬走，很神奇的功能。
从0式自动步枪开始生长，到形成成品，只需五个小时的时间，此时，刘云将枪支捡起来，甩掉面的残留培养液，然后装弹药……“突突突！”刘云向沙袋开了几枪，这步枪竟然能正常使用！而且他的心神扫描表面，这支步枪和通常生产的步枪没有什么两样，完全合格！这就证明数量庞大的纳米机器人确实能够建造宏观的东西。
“神奇！太神奇了！这预示着纳米时代的大门，正式开启！”刘云不由得惊叹道。
有了纳米机器人，刘云就有了“万能制造机”，通过模仿生物生长的方式，刘云完全可以在巨型培养箱里制造他想要的任何大型机械，甚至是军舰也可以制造！不久，刘云就拥有了第一辆“基地车”，可以通过基地车来生产各种建筑，然后制造各种机械、车辆、船只和飞机。
这种基地车，其功能更像《红色警戒3》里面升阳帝国的基地车，虽然刘云很讨厌小日本，但红警3里面小日本用纳米技术来建造各种建筑和单位的方式确实很先进。这不能怪谁，只能怪e的人干嘛把这么好的创意用在小日本这个阵营。基地车重20吨，超重的一辆载具，外形就像一辆巨型坦克。这么重的重量，是因为里面装载了大量的纳米核心，其中有一些可复制的纳米核心，剩下的就是可以拉出去建造的纳米建造核心。除此之外，还装了许多“培养包”和“能量包”。建造之时，先从基地车里开出一辆小车，小车里装着一个打包的纳米核心和足够的培养包、能量包，这样就是一个可以展开的纳米核心了，就像红警3里面的纳米核心一样。到了制定地点，那么小车本身就成了容器，然后纳米核心开始利用培养包和能量包里面的原料和能源来建造，然后就可以建造战车工厂甚至是船坞这种大型建筑。不过，纳米核心可不能一展开就完事，因为一个可展开的纳米核心不过五吨重，而修建的战车工厂总重却有几百吨，所以不能像游戏里一样完全忽略补给。事实，建造过程中需要卡车不断运输培养包和能量包，才能建成各种建筑。
当然，战车工厂和船坞这种建筑在生产载具、船只之时，也需要不断补充培养包和能量包，如果是固定的基地，那么可以用管道来输送培养液，至于能量包，只需补充一次，之后就可以用电能来充电了。现在，刘云的基地车所能建造的建筑，包括枪械厂、战车工厂、飞机制造厂、船坞，还有一些自行设计的防御建筑等，总之，自己想设计什么，纳米核心就能建造什么，但建造过程中消耗的是实打实的原材料和能源，而不是像游戏中那样只需消耗一个数字，又或者像系统建筑那样只需消耗一些橙色的资源块。