袁绍弃官而去之后董卓就更加嚣张了。现在董卓可以毫无顾忌地进行他的废立大计了。
三日之后董卓请少帝与文武百官来到嘉德殿说好听是商议废立皇帝说难听点就是他董卓一个人的意思。百官到位后董卓手握宝剑对百官言道：“当今天子暗弱不足以君临天下。今有策文一道宜为宣读。”董卓当即就命令李儒大声读出策文。
李儒张着他那特有阴险的嗓音道：“孝灵皇帝早弃臣民；皇帝承嗣海内侧望。而帝天资轻佻威仪不恪居丧慢惰：否德既彰有忝大位。皇太后教无母仪统政荒乱。永乐太后暴崩众论惑焉。三纲之道天地之纪毋乃有阙？陈留王协圣德伟懋规矩肃然；居丧哀戚言不以邪；休声美誉天下所闻宜承洪业为万世统。兹废皇帝为弘农王皇太后还政请奉陈留王为皇帝应天顺人以慰生灵之望。”
董卓早已等得不耐烦了等李儒读完董卓斥令御林军扶少帝下龙位没收少帝临时雕刻的玉玺向北面长跪称臣听命。又把何后从后面拉出来也一起跪在地上少帝与何后抱头痛苦百官皆有不忍之色。
尚书丁管愤怒大骂道：“逆臣董贼怎敢欺天之命妄谈废立天子大事吾当以颈血溅之。”说完丁管就挥舞着象牙简向董卓冲去董卓下令武士将丁管推出去斩。丁管骂不绝口至死神色不变。
董卓处理完丁管之后所有的大臣都安静下来了没有一个人敢出去言。董卓哈哈大笑请陈留王刘协登上帝位百官朝拜完毕董卓下令把少帝、何后与唐妃软禁到永安宫百官群臣没有董卓的命令谁也不能进入。陈留王刘协表字柏和乃灵帝中子登基后是为汉献帝改元初平董卓为相国赞拜不名入朝不趋剑履上殿威福莫比。
就这样公元189年9月董卓废少帝刘辩为弘农王立九岁的陈留王刘协为帝是为献帝。
董卓掌权之后李儒就劝董卓重用当世名流于是董卓就征当代名士蔡邕为官但是蔡邕不想去董卓恐喝道：“汝不来当灭你九族。”蔡邕无法只好硬着头皮上了董卓见到蔡邕之后也被他的才学所慑服一月三迁其官。
少帝、何后与唐妃被软禁在永乐宫之后连最基本生活用度都极为缺少一日少帝见一对燕子飞于庭中少帝有感而念出一足以断头之诗：“嫩草绿凝烟袅袅双飞燕。洛水一条青陌上人称羡。远望碧云深是吾旧宫殿。何人仗忠义泄我心中怨。”有人把少帝的这诗上报给董卓董卓哈哈大笑道：“怨望作诗杀之有名矣。”于是董卓就命令李儒带领武士把少帝、何后、唐妃鸩杀于永乐宫之内。
袁绍也是不甘寂寞之辈袁绍传书与司徒王允道：“董贼欺天废主人不忍言；而公恣其跋扈如不听闻岂报国效忠之臣哉？绍今集兵练卒欲扫清王室未敢轻动。公若有心当乘间图之。如有驱使即当奉命。”王允得书之后大喜召集几个忠于汉室的大臣们商议王允掩面痛哭道：“董卓欺主弄权社稷旦夕难保。想高皇诛秦灭楚奄有天下；谁想传至今日乃丧于董卓之手：此吾所以哭也。”百官听后都掩面而哭。然有一人却一抚掌大笑道：“满朝公卿夜哭到明明哭到夜还能哭死董卓否。”众人视之乃骁骑校尉曹操也王允大怒道：“汝祖宗亦食禄汉朝今不思报国而反笑耶。”曹操道：“我非笑它事我笑众位大臣竟无一计杀董卓操虽不才愿即断董卓头悬之都门以谢天下。”王允大喜道：“孟德有何妙计可除董贼。”曹操道：“近日操屈身以事卓者实欲乘间图之耳。今卓颇信操操因得时近卓。闻司徒有七宝刀一口愿借与操入相府刺杀之虽死不恨。”王允想要除去董卓独揽大权怎会稀罕一柄宝刀于是王允命人取来七星宝刀递给曹操道：“孟德果有是心天下幸甚。”曹操一拔出七星刀一看上面金光闪烁七颗宝石熠熠光果然不愧为绝世宝刀曹操拿着七星刀向众人拜别而去。
次日曹操带着七星刀来到相府问家丁得知董卓正在午睡曹操大喜吩咐家丁不要惊扰董卓自己进去便是。家丁见曹操也是董卓的心腹也不阻止他曹操径直来到董卓面前现董卓正在睡觉毫无清醒之状于是曹操慢慢的拔出七星刀一步步的向董卓逼近。眼看就要得手之际吕布正牵着一匹马进来曹操也是个老奸巨猾之人急忙跪地道：“操近得宝刀一把特来献于恩相。”董卓也慢慢醒来转身拿过宝刀一看见其刀长尺余七宝嵌饰极其锋利果宝刀也。董卓命令吕布手下董卓得刀大喜带着曹操来看吕布牵来之马曹操道：“果真西凉名马愿借来一骑不知恩相肯割爱否。”董卓得了曹操的七星宝刀了现在曹操要求他送匹马给他哪里还会拒绝。董卓道：“孟德不用客气此马就当赠你如何。”曹操大喜急忙牵马出相府快马加鞭往东南方而去。
曹操走后吕布对董卓道：“义父适来曹操似有行刺之状及被喝破故推献刀。”董卓也觉得可疑正好这时李儒来了董卓就把刚才之事告之李儒。李儒道：“操无妻小在京只独居寓所。今差人往召如彼无疑而便来则是献刀；如推托不来则必是行刺便可擒而问也。”于是董卓就命令四名御林军前去召唤曹操。御林军回来道：“曹操不曾回府中纵马飞出东门而去。”
董卓大怒道：“我如此重用于他他竟反要害我。”于是董卓下令遍行文书画影图形捉拿曹操擒献者赏千金封万户侯；窝藏者同罪。
此时萧言在临淄得知此事知道诸侯联盟共讨董卓之时快到了于是萧言下令沮授驻守北海从北海招回太史慈集合麾下众人随后将大本营移至济南二十万大军驻扎在济南等待时机。